针对金沙江下游梯级水库、三峡水库、丹江口水库、宗通卡水库、长江朱沱段、长江武汉段、汉江中下游、南水北调中线干渠全线等不同水域，分别建立了一二三维水生态环境数学模型。重点考虑污染物的迁移转化与吸附解吸特性、藻类的生长繁殖等，开展了纳污能力计算、水质模拟及污染物溯源、水温模拟、藻类水华预警、富营养化评估及防治、栖息地塑造模拟等工作，定量评估了水利工程的生态环境影响。