作为国家重点水利科研单位，长江科学院（简称长科院）以“维护健康长江、促进人水和谐”的新时期治江思路为宗旨，积极践行科学发展观，努力构建具有长江特色的创新型和谐组织，创建一流水利科研强院。在科研事业从工程水利向资源水利转变、从传统水利向现代水利和可持续发展水利转变的这一转型发展过程中，长科院始终坚持“两手抓、两手都要硬”的方针，不断创新思维，创新单位文化，在“爱水、爱江、爱院”文化的引导下，大力弘扬“创新、协作、诚信、奉献”的精神，以长科院的创新文化精神凝聚全院广大干部职工思想行动，在物质文明、政治文明、精神文明等方面取得了突出成绩。
　　2003年荣获“全国五一劳动奖状”，2008年荣获“全国水利科技工作先进集体”、“全国水利抗震救灾先进集体”和“湖北省直机关工委基层党组织建设红旗单位”，2009年荣获“湖北省直机关文明单位”，2010年荣获“长江委职工思想政治工作研究会建设突出贡献奖”，2011年荣获“2006-2010年度全国水利行业群众体育先进单位”，以及连续五年荣获“武汉市社会治安综合治理先进单位”等20多项表彰奖励。