水资源所通过20余年的发展，在长江大保护、治江重大战略、水资源管理和节约保护、河湖长制推动等方面取得了一系列成果，为长江委和流域内政府部门提供了重要的科技支撑和政策支持，收获了丰硕的科技创新成果，20余项科研成果获得省部级科技奖励。
序号 | 获奖成果名称 | 获奖等级 | 获奖时间 | 获奖等级 |
1 | 复杂引调水工程系统风险管控与综合效益提升关键技术 | 长江科学技术奖 | 2024 | 二等奖 |
| 2 | 流域复合旱涝过程模拟与应急调控关键技术 | 长江科学技术奖 | 2024 | 二等奖 |
3 | 三峡工程运行对下游河湖生态水文的影响及风险应对关键技术 | 长江水利委员会青年科学技术奖 | 2024 | 一等奖 |
4 | 干旱期湿地生态需水保障不确定性分析关键技术 | 长江水利委员会青年科学技术奖 | 2024 | 一等奖 |
5 | 鄱阳湖洪泛系统水文连通及其生态环境效应评估关键技术 | 长江科学技术奖 | 2024 | 二等奖 |
6 | 干旱风险下长江流域干支流多源供水协同调控关键技术 | 中国大坝工程学会科学技术奖 | 2023 | 一等级 |
7 | World Water Challenge(世界水挑战) | Outstanding(杰出奖) | 2023 | 一等奖 |
| 8 | 河南省平原区立体水网协同调控与功能提升关键技术及应用 | 河南省科学技术进步奖 | 2023 | 二等奖 |
9 | 寒区河流观测模拟与健康动态诊断关键技术及应用 | 长江科学技术奖科技进步奖 | 2023 | 二等奖 |
10 | 鄱阳湖洪泛系统水文连通及其生态环境效应评估关键技术 | 长江科学技术奖 | 2023 | 二等奖 |
11 | 基于蓝绿水统筹的流域水资源多维评价方法 | 长江委青年科学技术奖 | 2023 | 二等奖 |
12 | 长江上游梯级水库群多目标联合调度技术 | 大禹水利科学技术奖 | 2022 | 特等奖 |
13 | 长江流域干旱演变规律与旱灾风险综合评估及应对方法 | 长江水利委员会科学技术奖 | 2022 | 一等级 |
14 | 水价关键问题研究 | 中国价格协会 第八届“薛暮桥价格研究奖” | 2022 | 一等奖 |
15 | 鄱阳湖流域赣抚尾闾地区水文水环境演变与水系综合整治关键技术 | 长江科学技术奖 | 2022 | 二等奖 |
16 | 变化环境下高原湖泊脆弱性评价及水量水质协同配置关键技术 | 长江科学技术奖 | 2022 | 二等奖 |
17 | 非一致性条件下区域水资源不确定优化配置关键技术 | 长江委青年科学技术奖 | 2022 | 一等奖 |
18 | 长江上游巨型电站群水电调度运行决策支持关键技术 | 长江科学技术奖 | 2021 | 特等奖 |
19 | 大型泵站群调水工程调度关键技术 | 长江科学技术奖 | 2021 | 一等奖 |
20 | 梯级水电开发的生态效应及调控修复关键技术 | 中国大坝工程学会科学技术奖 | 2021 | 一等奖 |
21 | 长江流域（片）取水管控关键技术研究与实践 | 长江水利委员会科学技术奖 | 2021 | 二等奖 |
22 | 长江经济带协调协同发展战略问题研究 | 商务部商务发展研究成果奖 | 2020 | 二等奖 |
23 | 流域取水工程（设施）核查登记关键技术 | 长江委科学技术奖与青年科学技术奖 | 2020 | 二等奖 |
24 | 长江上游水库群防洪兴利适应性调控关键技术及应用 | 教育部科学技术进步奖 | 2019 | 一等奖 |
25 | 武汉市落实长江大保护的对策研究 | 湖北发展研究奖 | 2019 | 三等奖 |
26 | 流域梯级水电站协同调度关键技术与应用 | 水力发电科学技术奖 | 2018 | 一等奖 |
27 | 长江流域（片）水资源配置与调度关键技术研究与实践 | 大禹水利科学技术奖 | 2018 | 二等奖 |
28 | 长江上游水电开发生态制约及适应性研究 | 长江水利委员会科学技术奖 | 2017 | 二等奖 |
29 | 梯级水库群面向生态的多目标综合调度关键技术及汉江流域应用 | 湖北省科技进步奖 | 2016 | 一等奖 |
30 | 健康长江评价指标体系研究及应用 | 湖北省科技进步奖 | 2016 | 二等奖 |
31 | 长江环境流研究与应用 | 大禹科技进步奖 | 2013 | 一等奖 |